Як рэкурсійныя фармацэўтычныя прэпараты пашыраць наша разуменне клетачнай біялогіі

Хоць я люблю працаваць з заснавальнікамі і рызыкаваць інвестыцыі, я звычайна ненавіджу пісаць пра гэта. У большасці публікацый, якія я чытаў, я адчуваю сябе перашчыраваным і ў канчатковым выніку становіцца рэдукцыянісцкім да ўзроўню нізкай або адсутнасці карыснасці. Нягледзячы на ​​гэта, я адчуў патрэбу напісаць пра свае самыя апошнія стартавыя інвестыцыі. Кампанія, Recursion Pharmaceuticals, знаходзіцца на місіі, якая стаіць перад зменай не толькі фармацэўтычнай прамысловасці, але і ўсяго нашага разумення клетачнай біялогіі. Так, гэта больш тонкі і канкрэтны спосаб сказаць, што ён зменіць свет.

Я пакінуў шлях медыцыны больш за восем гадоў таму. Адной з прычын стала маё разуменне таго, што прыняцце клінічных рашэнняў з'яўляецца вельмі алгарытмічным. Больш дадзеных вядзе да больш ведаў, вядзе да большай дакладнасці і менш памылак. Перш чым даведацца пра гэта, лекарам не трэба рабіць дыферэнцыяльную дыягностыку і не планаваць план лячэння, таму што кампутары робяць гэта.

Другая кампанія, з якой я ганаруся, што інвеставала ў Tissue Analytics, з'яўляецца чыстай праявай гэтай рэалізацыі. Каманда TA стварыла лепшае ў сваім класе праграмнае забеспячэнне для вымярэння, аналізу і адсочвання хранічных ран. Гэта рашэнне вынікае з праблемы, якая з'яўляецца колькасна, якасна і візуальна вымерна і прадказальна. Выкарыстанае сотнямі клініцыстаў, праграмнае забеспячэнне рэзка зніжае чалавечыя памылкі, выключаючы яго цалкам з пэўных аспектаў працэсу. Ён таксама забяспечвае падтрымку клінічных рашэнняў, што спрыяе паляпшэнню клінічных вынікаў. Вымярэнне памяншэння болю і пакут пацыента і пазбяганне ампутацый даказваюць вялікую каштоўнасць.

Гэта праграмнае забеспячэнне наўпрост не дало пацыентам страціць канечнасці. Прачытайце гэта яшчэ раз, пакуль не ўстанецца. Цяпер, маючы бібліятэку раненых малюнкаў і глыбокі клінічны кантэкст, праграмнае забеспячэнне можа даць больш зразумелыя дадзеныя, якія перавышаюць магчымасці чалавека. Перавызначэнне рабочага працэсу з выкарыстаннем камп'ютэрнага зроку і машыннага навучання змяняе праблемы, якія можна вырашыць, і дае рашэнні, якія раней лічыліся немагчымымі.

Рэкурсійныя фармацэўтычныя прэпараты выкарыстоўваюць той самы падыход, пласт глыбей. У той час як Tissue Analytics назірае паразы скуры, рэкурсія апускаецца да ўзроўню клетак, каб выявіць малекулы, якія могуць лячыць рэдкія, складаныя захворванні. Уявіце, як чалавек прасее іголку за сенаю. Цяпер уявіце сабе машыну, якая глядзіць на кожную нітку сенажу хутчэй і з упэўненасцю. Гэта рэкурсія.

У стандартных трубаправодах для распрацоўкі лекаў чалавек візуальна аналізуе слайды клеткавай тканіны, каб убачыць дзеянне выпрабавальнага злучэння на здаровую і хворую тканіну. Гэта патрабуе часу і схільна да памылак. Рэкурсія дае гэтую задачу машыне, што дазваляе вывучаць значна больш камбінацый тканін і злучэнняў з меншай памылкай. Глыбіня гэтага даследавання таксама экспанентна павялічваецца з 1-2 функцый на слайд да 100s або 1000s функцый на слайд. Гэтая тэхналогія дазваляе больш "грубога" падыходу да выяўлення наркотыкаў, ужываючы шматлікія лекі для некалькіх захворванняў, каб даведацца, якія з іх працуюць. Папярэдні спосаб у большасці выпадкаў быў (і дагэтуль) праслаўляў здагадкі.

Рэкурсія крок за крокам

Эмпірычны падыход да выяўлення наркотыкаў мае сэнс інтуітыўна; гэта дагэтуль было немагчыма. З больш чым трыццаццю кандыдатамі на лекі пры больш чым дваццаці захворваннях можна з упэўненасцю сказаць, што тэхналогія працуе. Але пачакайце, ёсць яшчэ. Два мільёны новых малюнкаў і дваццаць тэрабайт дадзеных, якія генеруе Рэкурсія штотыдзень, выходзяць за рамкі выяўлення кандыдатаў на наркотыкі. Набор дадзеных дазваляе больш глыбока зразумець чалавечую і клетачную біялогію. Бібліятэка малюнкаў дае ўсё больш інфармацыі пра тое, як паводзяць сябе клеткі ў пэўных умовах, што прыводзіць да разумення таго, чаму яны так паводзяць сябе.

Мы можам бачыць клеткі пры дапамозе мікраскопа, і мы можам вымераць ДНК і РНК ўнутры гэтых клетак з пэўным узроўнем надзейнасці. Паміж клеткамі і іх генетычным кодам ёсць вобласці біяхіміі і малекулярнай біялогіі. Мы заўсёды рабілі выгляд, што ўпэўненыя ў біяхіміі і малекулярнай біялогіі, чым мы на самай справе, але гэта на тым узроўні, дзе адбываецца магія. З дапамогай рэкурсіі мы можам скарыстацца здольнасцю назіраць за клеткамі і клеткавай тканінай і ўжываць вылічальны падыход, каб лепш зразумець, што адбываецца ўнутры іх. Замест таго, каб выказаць здагадку пра ўзаемадзеянне паміж малекуламі, якія нам нябачныя, мы можам паспрабаваць выпрабаваць дастаткова камбінацый, каб даведацца, што працуе, а што не. Такі падыход дае рэкурсіі разуменне клетачнай біялогіі за межамі таго, што было чалавецтву на сённяшні дзень, і магчымасць выявіць лячэнне раней невылечных захворванняў. Цяпер пра гэта варта пісаць дома.

Вялікая падзяка Нан ​​Лі ў Відавочным за знаёмства з Крыстаферам Гібсанам у "Рэкурсіі", а таксама Заваін Дар у Люкс і Майкл Дэмпсі ў "Падворку" за іх уклад.

Ад кампаніі: Recursion Pharmaceuticals з'яўляецца новай біятэхналагічнай кампаніяй, якая аб'ядноўвае эксперыментальную біялогію, аўтаматызацыю і штучны інтэлект у шырока паралельнай сістэме, каб хутка і эфектыўна вызначыць метады лячэння любых захворванняў, якія можна мадэляваць на клеткавым узроўні. Платформа рэкурсіі была выкарыстана для вызначэння новых патэнцыйных метадаў лячэння генетычных, запаленчых і анкалагічных захворванняў і шырока ўжываецца ў дадатковых галінах біялогіі, уключаючы інфекцыйныя захворванні і хваробы старэння. Заснаваны ў 2013 годзе, тэхналагічны падыход Recursion дазволіць лячыць хваробы ў долі тыповых часовых рамкаў і з доляй кошту, і ў канчатковым выніку прывядзе кампанію ў стварэнне дарожнай карты клетачнай біялогіі чалавека.